No passado distante, a próspera nação de Karma travou uma guerra contra a nação de Spectra, resultando na criação de uma IA que eliminou todos os humanos. Séculos depois, Raye, o último humano sobrevivente, vive entre uma sociedade andróide nos arredores de Karma. Na noite de seu aniversário de 13 anos, sua vida pacífica é abalada quando Spectra ataca, destruindo sua casa e forçando seus amigos a irem para a linha de frente. Desesperada para salvar tudo o que ela ama, Raye invoca o último bastião da humanidade: "Sky Striker", a tecnologia secreta desenvolvida pelo Karma para transformar humanos em armas vivas definitivas.... Inesperado, certo? Nesta mais nova adaptação de Yu-Gi-Oh, o foco da trama não está no jogo de cartas, mas sim nas várias histórias apresentadas nas cartas. O primeiro arco envolve a série Sky Striker, com mais por vir no futuro.